Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms