Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms