Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms