Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms