Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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