Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms