Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms