Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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