Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms