Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms