Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms