Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms