Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KB2Q9UBS0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KB2Q9UBS0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms