Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms