Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms