Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms