Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms