Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XAB2Q9HCS7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms