Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms