Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms