Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL3Q9H2J4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCL3Q9H2J4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms