Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms