Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms