Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HDAC8Q9BY41 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HDAC8Q9BY41 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HDAC8Q9BY41 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms