Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms