Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms