Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms