Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms