Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSRNP1Q96S65 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms