Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms