Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms