Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms