Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF354BQ96LW1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms