Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms