Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2Q96I99 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms