Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYTL4Q96C24 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms