Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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C11orf40Q8WZ69 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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C11orf40Q8WZ69 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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C11orf40Q8WZ69 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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C11orf40Q8WZ69 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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C11orf40Q8WZ69 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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C11orf40Q8WZ69 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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