Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATL2Q8NHH9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATL2Q8NHH9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATL2Q8NHH9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATL2Q8NHH9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATL2Q8NHH9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATL2Q8NHH9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATL2Q8NHH9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATL2Q8NHH9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms