Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SP140L-202ENST00000396563 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 RPL32P3-206ENST00000510078 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SVIPQ8NHG7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms