Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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