Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms