Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM71DQ8N9W8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms