Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms