Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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