Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms