Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms