Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms