Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms