Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI47

KCTD18, BTB/POZ domain-containing protein KCTD18, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD18Q6PI47 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD18Q6PI47 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms