Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LETMD1Q6P1Q0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms